アプライアンスのワイヤレス機能は、有線ポートと違うネットワークセグメントに設定することができますか？

はい、できます。
作成したアクセスポイントのネットワークに、有線のインターフェースと同様、独立したTrusted, Optional, Custom, Bridge, VLANを設定することができます。