外部からのSMTPメールにてウィルスを検知した場合に拒否するのではなくメールを隔離したいです。可能でしょうか？

可能です。 ただしデバイスの内部に隔離することは不可能なのでWatchGuard System Managerに含まれるQuarantine Serverを別途Windowsサーバへインストール／設置して頂き、そのサーバへ隔離することが可能です。